En 1886, l’abbé Humez, curé d’Asnières crée une école paroissiale de garçons au 3 rue du Bac. Trois frères du Sacré Coeur en prennent la direction en 1894 à la demande de l’Abbé Sévillot.
1919 marque l’acquisition du pavillon Bouthemy au 33 rue de Nanterre (ancien pavillon administratif avec entrée 1 rue du Bac) et de deux autres propriétés au 3 rue du Bac où sera construite en 1923 une école accueillant 400 élèves.
Un collège ouvre en 1941. Entre temps, un bâtiment est loué au 9 rue du Bac. L’achat du pavillon Martin (actuellement : résidence des Frères, chapelle, salle à manger des personnels) au 33 rue de Nanterre est réalisé en 1957.
En 1968, le bâtiment principal actuel est construit au 9 rue du Bac, après construction de préfabriqués en 1963.
Acquisition en 1978, au 28 rue de Nanterre d’un entrepôt aménagé ensuite en salle de sports.
L’établissement devient mixte en 1981 et le centenaire de l’Institution est célébré en 1986.
1994, construction de 3 classes supplémentaires au 9 rue du Bac, dont la salle multimédia.
Construction en 1996, au 3 rue du Bac, de 4 nouvelles salles de classe, dont une seconde salle de technologie.
Le gymnase, réhabilité sur le site de l’ancienne salle de sports, est inauguré et mis en service en janvier 2004.
2009 : Construction de la nouvelle Ecole maternelle et élémentaire, inauguré en janvier 2010.
2014 : rénovation totale du collège, avec la construction d’un nouveau bâtiment
30 mai 2018 : Dévolution de tutelle de l’établissement Saint Joseph à la congrégation des Salésiens de Don Bosco
Les Frères du Sacré Cœur, dont l’œuvre a été fondée par le P. André Coindre et auquel était rattaché Saint Joseph, ont estimé ne plus être en capacité de bien assurer l’accompagnement nécessaire des établissements dont ils avaient la charge. En lien avec les laïcs responsables de ces établissements, ils ont réfléchi et ont finalement opté pour un rapprochement avec les Salésiens de Don Bosco, dont la tradition éducative semblait proche de la leur.
Saint Joseph a reçu le label Campus International Don Bosco
En septembre 2020, l’institution Saint-Joseph reçoit le label Campus International Don Bosco et impulse ainsi une ouverture vers l’international grâce aux projets pédagogiques et aux échanges avec l’Europe.